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臺北市長柯文哲29日出席臺北市政府104年度首長領航營，柯文哲致詞時即宣布下周即將上任百日，他要求市府每個局處要交出這百日內做了那些政績摘要，因為有時候自己的政績要自己表揚，另外，在市議會開議之前，各局處也要在交出三樣報告，分別是上任一年、四年以及五十年後預計要完成的施政計畫。柯文哲說，施政要有方向才能夠做事。
柯文哲提到昨晚閱讀時看到有關成吉思汗的統治學，他認為長官最重要的是在指出方向，而非做規劃，他建議在場局處首長每天在做事時應該想想自己的方向是什麼？柯文哲同時分享證嚴法師曾說：「只要方向對了，就不會怕路遙遠。」，但如果方向不對走再快也沒有用。另外，為什麼要檢視每個人的方向，柯文哲舉例就跟數學向量一樣，如果每個人的向量互相牴觸這樣加起來的向量數就會很少，所以大家方向都要確定。
柯文哲表示，基本上他不贊成由上而下，就是每個人去想自己想做的事情，這點比較接近亞當史密斯的想法「每個人追求他的最大利益，合起來就是社會的最大利益」，所以長官要做的事情有幾樣，首先指出方向，接續看大家的方向再來協調，每個人做自己的事情，有衝突長官再來處理，而解決衝突是長官最重要的工作。再來就是堅持價值，像這次226計畫會成功最重要的一點就是堅持，過程當中沒人敢來跟我關說，因為大家都知道來講都沒有用。
柯文哲談到有人問他當臺北市長最想改變的是什麼？他認為是改變企業文化，改變成反省改進的企業文化，反省改進最根本的就是講實話，這種文化建立後，速度就會很快，就很好做事，他提到企業裡面最貴的人事成本就是建立及維持企業文化，因此他現在要逐步建立北市府的企業文化，估計建立時間要半年以上。
致詞當中，柯文哲不斷強調SOP重要性，有SOP就可以檢討出錯的環節，看是人的問題還是制度的問題，也可以做統計分析，並使得標準一致。他說，建立起SOP之後，就算日後首長換人，但制度仍然可以保存沿用。
柯文哲也提到「0.9理論」來提醒及勉勵大家，提到過去在臺大醫院，如果說當年的麻醉技術是現在的0.9，體外循環、術後護理照顧等等，每樣都是0.9，0.9乘以0.9一直乘下去，就會趨近於零，這表示每個地方都差一點，合起來就完蛋了。因此進步是很重要的概念，進步是累積的，每個人都做小小的進步，累積起來就是很大的能量。
最後，柯文哲結語以要「堅持做對的事情，重建人民對政府的信任」，「以事前的溝通，取代事後的衝突」，「隨時反省，錯了就改，誠實面對」，「人民的小事就是政府的大事」，並向大家喊話：「那我們就開始用常識去理解這個國家」。
會前，市長接受媒體聯訪時被問到沒有睡飽是否應該修個假？柯文哲表示，睡眠時間都不夠，但他只要有睡飽就可以了。
有關今日首長領航營，參訓的局處首長好像心情都很緊繃？柯文哲表示，他也很納悶課程會排到晚上九點，把兩天的課程排到一天，但他個人是可以接受這樣的安排，只怕其他人受不了。
媒體接續問到，今日下午課程都著重在府會關係及媒體宣傳的部分？柯文哲表示，其實溝通蠻重要的，他發現在整個政治運作裡面最難的就是溝通部分，就像他以前在臺大醫院的經驗一樣，絕大多數的醫療糾紛都是溝通不良，所以政治亦同，絕大多數的誤會、阻礙也都是因為溝通不良。所以要花更多時間來讓大家上溝通課程。
有關經濟部表示有意跟北市調整水價，問目前情況為何？柯文哲說，因為全臺灣的水價分兩個價格，一個是臺北市的水價，除臺北市外又是另一個價碼，這沒有道理，所以要兩邊坐下來談，而且要談的東西很多。
媒體問到若水價調漲，市長是否擔心市民反彈？柯文哲回答，若便宜已經佔了20-30年，突然要公平計算，佔便宜的人就會覺得不公平，因此這就需要去溝通。
媒體接續問到，若臺北市水價要與其他縣市相同，北市水價將要調整三成？柯文哲表示，北市府會透過一個差別式的費率來解決，他認為若用水是在20度以內或是少量的家庭用水，會調整成與現在水價沒甚麼差別。但是大量的用水戶水費就會調高一點，到時會想辦法調整到對一般住民沒有影響的情況。
媒體問市長有想過怎麼跟市民溝通水價調漲的方式?柯文哲表示，目前還有一年的時間可以慢慢想，但第一點就是要「講明」，講清楚就是一個很大理由。
媒體問到28日晚間市長回應總統府新聞稿問題的時候有點生氣？柯文哲表示，理論上從上任之後應該有很多新的事物要做，結果卻花很多時間在善後，都在處理以前不知該怎麼辦的事情，他認為這些應該都可以避免，有的部分看起來太奇怪了，但政治是連續性也沒有辦法，還是會儘量去善後。
有關大陸小組成員傳出市長聽到九二共識時臉色一沉就不講話了？柯文哲回答，這個都是重點問題，每天都在應付這些很困難的題目，就是有問題才要找大家商量。
媒體問市長中山設計園區是否不蓋了？柯文哲表示，蓋還是會蓋，只是不想再用BOT的方式，這也是他在思考以前的聯開宅都一定要找建商進來，他認為很奇怪，為什麼要找建商進來再給他抽成，如果政府可以公辦，把圖設計好了之後再來蓋就不用給建商抽成了，如果政府有能力做就直接直營，沒有能力才用BOT。
媒體問到建國啤酒廠蓋公共住宅是否喊停？柯文哲表示，建國啤酒廠應該不會拿去蓋公共住宅，等細節確定再跟大家公布。