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悠遊卡所有票卡種類(包括悠遊聯名卡、悠遊電信卡)均適用代墊機制，但僅限於搭乘大眾運輸交通工具可使用代墊乙次，以60元內為限，其餘小額消費或非大眾運輸交通工具皆無法代墊，說明如下：
一、臺北捷運：可代墊乙次。
二、段次公車：可代墊乙次，另當趟搭乘為兩段票，但第一段票已代墊過乙次，第二段票則無法再代墊扣款，持卡人需另以現金繳付當趟車資。
三、臺鐵：可代墊乙次。
四、高鐵：僅限悠遊聯名卡可代墊，如餘額不足支付該次應付票價時，系統將自動計算差額並以500元倍數為單位，完成最低金額自動加值，以利扣除應付票價。
五、藍色公路(渡輪)：可代墊乙次，另長弘航業無代墊功能。
六、除上述各運具，本市停車場、計程車及微笑單車不適用悠遊卡代墊功能，請持卡人使用相關服務時注意。
另悠遊卡提供之代墊機制由悠遊卡公司不定期更新於該公司官方網站之「顧客服務」─「常見問題」專區(http://www.easycard.com.tw)，敬請悠遊卡持卡人至該網站查詢最新資訊。