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臺北市政府工務局水利工程處自102年開始調查河濱公園生態資源，目前已完成淡水河、新店溪、景美溪及雙溪河濱公園調查工作，發現北市河濱生態非常豐富，有台灣特有種的土肉桂，也有保育類臺北樹蛙，歡迎民眾至「臺北市河濱生態資訊網」下載調查成果相關資訊，一起探索河濱生態的奧秘。http://www.riversidepark.taipei.gov.tw/ecoriverside
水利處說明，調查工作迄今共紀錄到863種植物，其中臺灣特有種土肉桂用途廣泛，比如可樂中特有的香辛風味，就是出自於肉桂中的肉桂醛。另外，從關渡水岸公園，一路上溯到新店溪的華中橋下，都可見到水筆仔的蹤影，因為它是溪濱泥沼濕地的主要樹種。
調查報告中指出，河濱鳥類約有134種，以10月至隔年4月鳥類最豐富，最適合賞鳥。屬於第二級珍貴稀有保育類的鳥種中，以八哥數量最多且有穩定留鳥族群。河濱地區有6種外來種鳥類數量最多且有繁殖族群存在，分別是野鴿、白尾八哥、家八哥、黑領椋鳥、埃及聖䴉以及輝椋鳥。
另外，兩棲類共發現18種，包含保育類臺北樹蛙和特有種翠斑草蜥，也在社子島及福和橋周邊發現外來入侵種斑腿樹蛙，水利處依據監測資料擬定防治策略。爬蟲類共22種，包含保育類飯匙倩。蝴蝶共有62種、蜻蜓共32種及底棲生物共43種。
102年起，水利處開始調查河濱公園生態資源，調查對象包含植物、鳥類、兩棲類、爬蟲類、蝴蝶、蜻蜓、底棲動物，經分析建立各區位指標物種，作為後續環境規劃利用及生物多樣性資源管理依據。調查成果建置為「臺北市河濱生態資訊網」http://www.riversidepark.taipei.gov.tw/ecoriverside開放給大眾查詢，網站中並免費提供解說摺頁、導覽手冊電子檔的下載，給有興趣民眾下載使用。
水利處表示，明（106）年將再繼續辦理基隆河系河濱公園生態調查工作，預計107年完成。未來，水利處會持續監測河濱生態資源，調查成果回饋到環境規劃利用、環境教育、環境改善、及生物多樣性資源維護，以打造永續生態城市。