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針對<自由時報>網站新聞有關鄧家基副市長今（6）日下午在臺北市前進指揮所的發言報導，鄧家基澄清表示，他記得他是在跟民航局副局長李萬里講說，「大家救災都通力合作，沒有關係，有人說我們不團結、不和諧，這種報導多了就見怪不怪了。」相關報導可能未盡完整，盼能釐清訊息。
鄧家基副市長強調，他會談到救災都是經驗的累積沒錯，但針對意外災難，他不可能去提到所謂的見怪不怪的說法，真的可能傳聞有誤會，擔心這樣的報導會引發不好效應，希望能盡速釐清此事。
至於所謂的「不會開飛機，經常搞飛機！」鄧副市長表示，他在跟李副局長打招呼時，因為李副局長提到他是開飛機出身，鄧副市長回應他不會開飛機但搞過飛機，這樣的說法，也絕無惡意，若造成誤會，他感到非常抱歉。
鄧家基副市長指出，他在意外發生第一天的第一時間就趕到現場坐鎮指揮全力救災，希望可以盡快找出失蹤的旅客，也在現場指揮待到晚上十二點半。昨天和今天也都前往現場關心，鄧家基強調他非常關心救援進度，希望大家同心協力讓一切都圓滿完成。