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臺北捷運系統列車正常運行方式係由列車之號誌電腦依據從道旁收到的速度指令控制列車之加減速及進站停車，停車位置有時會因天候因素(如雨天)，而影響停車位置準確性，故系統於停準點設計有前後30公分之可容許誤差，在正常情況應皆能對準月臺標示之旅客上下車位置。

於列車發生未準確停靠狀況時，相關處理程序說明如下：

1.列車越位未達一個車門

司機員回報行控中心，獲其核准後手動開啟月台門、車門讓旅客上下車。

2.列車越位一至兩個車門

司機員回報行控中心後，退回正確停車位置再讓旅客上下車，或於回報行控中心並執行廣播告知旅客本站不開門，請下車旅客於下一站改搭另一方向列車回本站後，駕駛列車至下一車站月臺讓旅客下車。

3.列車越位超過三個(含)車門以上

(1)司機員依規定回報行控中心且不開啟車門，於執行廣播告知旅客本站不開門，請下車旅客於下一站改搭反向列車回本站後，駕駛列車至下一車站月臺停靠。

(2)若係於終端站、折返站、末班車時發生越位狀況，行控中心會指示司機員將列車退回正確位置。